En 2008, la escultura móvil Carmen de Alexander Calder, llevaba veinte años en el centro del jardín del edificio Sabatini. La exposición continuada al aire libre durante todo este tiempo había alterado el color de sus piezas y era preciso realizar una intervención para devolver la policromía original a la obra. Debido a la acción del tiempo y a las condiciones climáticas, el color de las placas se había deteriorado considerablemente. Por otro lado, la plataforma de hormigón donde la escultura se había instalado para evitar su hundimiento en el terreno, impedía un correcto drenaje del agua de lluvia formando charcos junto a la base que habían provocado la oxidación de la misma.
Con motivo de la exposición Crystal Times. Reflexión sin sol /Proyecciones sin objeto que tuvo lugar entre el año 2009 y 2010 en el Palacio de Cristal y el Edificio Sabatini, el Departamento de Conservación-Restauración llevó a cabo una documentación exhaustiva del montaje de la obra Peana CRYSTAL TIMES que formó parte de la exposición.
Con motivo de la reordenación de la colección permanente, en marzo de 2010 se llevó a cabo el traslado interno de la pieza Toki-Egin (Homenaje a San Juan de la Cruz) de Eduardo Chillida. Esta pieza estaba situada en la cuarta planta del Edificio Sabatini y su peso, superior a 9 toneladas, dificultaba enormemente su movimiento.